排水沟淹没农田是一种常见的农田灾害，对农田的耕作和农作物的生长造成了严重的影响。在法律上，对于排水沟淹没农田的处理，可以从以下几个方面进行考虑和解决。
首先，农田淹没是一种自然灾害，因此可以根据相关法律规定，农田主可以向当地政府申请灾害救助。政府应当根据实际情况，对受灾农田进行评估，并给予相应的补偿和救助。这包括对农田的修复和恢复工作，以及对农民因此遭受的经济损失进行补偿。
其次，排水沟淹没农田可能涉及到土地使用权的问题。根据土地管理法和农村土地承包法等相关法律规定，农田的使用权属于农民集体所有，农民有权对自己的土地进行合理利用和保护。如果排水沟淹没农田是由于相关部门的工程建设或管理不善导致的，农民可以依法要求相关部门承担责任，并要求恢复农田的原状。
此外，排水沟淹没农田还可能涉及到环境保护的问题。根据《中华人民共和国环境保护法》等相关法律规定，任何单位和个人都有责任保护环境，防止环境污染和生态破坏。如果排水沟淹没农田是由于相关单位的违法行为或不当操作导致的，农民可以依法向环保部门投诉举报，并要求相关单位承担相应的法律责任。
最后，为了避免类似问题的再次发生，相关部门应当加强对排水沟的管理和维护工作。这包括加强对排水沟的巡查和维修，确保排水沟的畅通和正常运行，以减少对农田的影响。同时，相关部门还应当加强对农民的宣传和教育，提高农民的环境保护意识和法律意识，引导农民合理利用土地资源，保护农田的生态环境。
综上所述，对于排水沟淹没农田的处理，可以从灾害救助、土地使用权、环境保护和管理维护等方面进行考虑和解决。通过加强法律保护和管理，可以有效地维护农民的合法权益，保护农田的生态环境，促进农业的可持续发展。